INFRAESTRUCTURA
Source: https://corefacilities.uniandes.edu.co/metcore/ Parent: https://investigacioncreacion.uniandes.edu.co/es/noticias
Metcore es el primer Core Facility en Metabolómica de Colombia y uno de los primeros en Latam. Brinda acceso a la última tecnología de análisis de metabolitos y colabora activamente en el desarrollo de proyectos y experimentos con metabolómica.
Metcore presta servicios especializados, participa en proyectos de investigación y realiza actividades de formación en análisis metabolómico en diferentes sectores, de biomedicina, alimentos, biotecnología, entre otros.
INFRAESTRUCTURA
Procesamiento de datos
MetCore
Análisis de muestras
MetCore
Análisis de datos
MetCore
Análisis de muestras
MetCore
Procesamiento de datos
MetCore
Laboratorio MetCore
MetCore
Preparación de muestras
MetCore
Te ayudamos a diseñar tus análisis metabolómicos para que obtengas resultados confiables y de alta calidad.
Nuestro flujo de trabajo nos permite ser flexibles y realizar los análisis metabolómicos según tus necesidades
Profesionales con amplia experiencia en la química analítica, especialmente en metabolómica y lipidómica.
Podrás realizar el servicio de análisis metabolómico completo o escoger las etapas del análisis metabolómico que requieres.
Infraestructura moderna dedicada al análisis metabolómico y lipidómico, siguiendo las recomendaciones de QA & QC en análisis metabolómico.
Contamos con librerías de estándares con más de 2000 metabolitos que nos permite llegar a niveles de identificación más altos (Nivel 1)
Brindamos una solución completa de análisis metabólico desde la preparación de muestras hasta el procesamiento y análisis de datos.
Preparación de muestras
Ultracongeladores, Congeladores Refrigeradores, Cabina de Bioseguridad Clase II Tipo B2, Microcentrífuga Refrigerada, SpeedVac, TissueLyser, Purificador de Agua Tipo I.
Análisis de la muestra
- Agilent LC 1260
- Agilent CE 7100
- Agilent Q/TOF 6545
- Agilent GC-Q/TOF 7200
- Agilent QqQ 6470
Procesamiento y análisis de datos
- Agilent Mass Hunter: Profinder, Profiler Professional (MPP), Unkonwn Analysis, lipid annotator.
- SIMCA, Matlab, MetaboAnalyst
- CFM-ID, MS-DIAL, CEU Mass mediator, HMDB, METLIN, Lipid maps, MetFrag, Mass Bank, KEEG, among others.
- Librerias “In house” con más de 2000 estándares de metabolitos
GC-QTOF-MS
Agilent-GC-Q-TOF
LC/CE-QTOF-MS
Agilent-Q-TOF
LC/CE-QqQ-MS
Agilent QqQ 6470
FLUJO DE TRABAJO
Preparación de muestras
Se realiza la extracción de metabolitos según los protocolos previamente establecidos en el Centro. En los casos que se requiera una preparación de muestras diferente, esta debe ser realizada por el cliente o solicitarse como servicio personalizado.
Análisis de muestras
Análisis no dirigido por la plataforma seleccionada, GC-MS, HPLC-MS, CE-MS.
Procesamiento de datos
Incluye los pasos de deconvolución, alineamiento, integración y filtrado de los datos, generando una matriz de datos las características moleculares (molecular feature) con la respectiva abundancia en cada muestra. Esta matriz de datos se entrega en un archivo Excel, el cual se encuentra listo para el análisis de datos.
Análisis de datos
Análisis de datos univariado y/o multivariado permitiendo seleccionar los metabolitos responsables de las diferencias entre grupos. Curvas ROC.
Identificación de metabolitos
Anotación de los metabolitos responsables de las diferencias entre grupos empleando librerías comerciales, libres e in-house. Cada metabolito es reportado en el respectivo nivel de identificación según las “Metabolomics Standards Initiative guidelines” (Blaženović, I.; Kind, T.; Ji, J.; Fiehn, O. Software Tools and Approaches for Compound Identification of LC-MS/MS Data in Metabolomics. Metabolites 2018, 8, 31).
Análisis de rutas biológicas
Análisis de enriquecimiento, análisis de rutas alteradas.
SERVICIOS
Investigamos y prestamos servicios especializados en metabolómica
Metabolómica no dirigida
Los análisis de metabolómica no dirigida se realizan con espectrometría de masas de alta resolución empleando un cuadrupolo acoplado a un tiempo de vuelo (Q-TOF) acoplado a diferentes sistemas de separación como cromatografía de gases, líquidos y electroforesis capilar.
- Análisis metabolómico no dirigido por GC-QTOF-MS.
- Análisis metabolómico no dirigido por RP-HPLC-QTOF-MS.
- Análisis metabolómico no dirigido por HILIC-HPLC-QTOF-MS.
- Análisis metabolómico no dirigido por CE-QTOF-MS
Para los análisis no dirigidos se ofrece el servicio completo o parcial según el interés del cliente.
Perfiles metabólicos
Determinación de metabolitos y lipidos en matrices biológicas empleando HPLC-QQQ-MS
- Perfil de aminoácidos
- Perfil de compuestos fenólicos: 50 compuestos fenólicos (Ver lista de compuestos fenólicos)
- Perfil de flavonoides: 44 flavonoides (Ver lista de flavonoides)
Lipidómica no dirigida
Los análisis de lipidómica no dirigida se realizan con espectrometría de masas de alta resolución empleando un cuadrupolo acoplado a un tiempo de vuelo (Q-TOF) acoplado a cromatografía de líquidos.
- Análisis lipidómico no dirigido por RP-HPLC-QTOF-MS and HILIC-HPLC-QTOF-MS.
Para los análisis no dirigidos se ofrece el servicio completo o parcial según el interés del cliente.
Metabolómica y lipidómica dirigida
Determinación y cuantificación de metabolitos en matrices biológicas empleando HPLC-QQQ-MS
- Cuantificación de Cortisol y cortisona
- Cuantificación de Ceramidas.
Desarrollo de métodos de análisis para cuantificación de metabolitos.
Caracterización de metabólitos
- Caracterización de metabolitos en matrices biológicas empleando GC-QTOF-MS.
- Caracterización de metabolitos en matrices biológicas empleando RP-HPLC-QTOF-MS.
- Caracterización de lipidos en matrices biológicas empleando RP-HPLC-QTOF-MS.
Los metabolitos y lípidos son caracterizados empleando diversas librerías disponibles en MS-DIAL, Fiehn, NIST, así como las librerías in-house construidas con datos experimentales adquiridos en nuestros equipos usando las librerías de IROAC: “Mass Spectrometry Metabolite Library of Standards (MSMLS)”la cual es una colección de 600 pequeñas moléculas bioquímicas de gran pureza que abarcan una amplia gama del metabolismo primario, y Phytochemical Metabolite Library of Standards (PHYTOMLS) la cual es una colección de 364 fitoquímicos de alta calidad producidos por plantas.
EQUIPO
PhD. Mónica Cala
Líder e investigadora MetCore
Química, magíster en Química y Doctora en Ciencias Químicas.
Ver perfil Academia\ Ver perfil ORCID\ Ver CvLAC
CONTACTO
metcore@uniandes.edu.co *Conmutador (601) 3394949 \ Extensión 1429*
Universidad de los Andes\ Carrera 1 N° 18a-10, Bloque Q, Q-300\ Bogotá, Colombia
MSc. Mary Santamaria
Analista de laboratorio
Química, magíster en Ciencias Biológicas.
BSc. Lizeth León
Analista de laboratorio
Química, candidata a magíster en Ciencias – Bioquímica.
PhD. Daniel Pardo
Profesional proyectos de investigación
Biólogo, magíster en Ciencias Biológicas y doctor en Ciencias Biológicas.
PhDc. Laura Rojas
Profesional proyectos de investigación
Licenciada en Química, magíster en Ciencias Biológicas y candidata a doctora en Ciencias Biológicas.
PhD. Luis Chitiva
Profesional proyectos de investigación
Licenciado en Química, magíster en Química, doctor en Ciencias Biológicas y en Ciencias Químicas.
PhDc. Ana León
Auxiliar proyectos de investigación
Química, magíster en diseño de procesos y productos y candidata a doctora en Ingeniería.
Centro de investigación en Metabolómica MetCore (COL0220419)
Nuestro principal objetivo es facilitar e impulsar la investigación en metabolómica en nuestro país y región. En MetCore colaboramos de manera activa en el desarrollo de proyectos y experimentos con metabolómica en diversas áreas de investigación.
- BIOMEDICINA: Diagnóstico de enfermedades, diagnóstico y fisiopatología.
- ALIMENTOS: Producción y procesamiento industrial de alimentos.
- BIPROSPECCIÓN: Alternativas terapéuticas y fitoterapéuticas.
Nuestros socios
MetCore hace parte de una alianza estratégica con AGROSAVIA, Pontificia Universidad Javeriana y Universidad del Rosario, donde se busca promover la cooperación académica a través de la investigación entre las diferentes instituciones.