INFRAESTRUCTURA
Source: https://corefacilities.uniandes.edu.co/gencore/ Parent: https://corefacilities.uniandes.edu.co/metcore/
El Centro deSecueciación–GenCore de la Vicerrectoría de Investigación y Creación es un laboratorio consolidado en la prestación de servicios de alta calidad en secuenciación de nueva generación, electroforesis capilar y técnicas de biología molecular en general, con experiencia de más de 10 años. Somos proveedores para la comunidad científica general, Universidades, empresas farmacéuticas y de biotecnología.
Somos el único laboratorio de secuenciación en Colombia certificado como proveedor de servicios de la tecnología de secuenciación de OxfordNanoporeTechnologies (ONT).
INFRAESTRUCTURA
Nuestra infraestructura incluye plataformas robustas de secuenciación, además de otros equipos, tales como: Qubit (Thermo Fisher Scientific) y Agilent Bionalyzer 2100 (Agilent Technologies) para la cuantificación de ácidos núcleicos y proteínas; termocicladores de tiempo real CFX96 (Bio-Rad), QuantStudio (Thermo Fisher Scientific); y de PCR digital dPCR: QIAcuity (QIAGEN), además de equipos automatizados para extracción de ácidos nucleicos.
Plataforma
GridION
Oxford Nanopore Technologies (ONT)
Plataforma
PromethION & GridION
Oxford Nanopore Technologies (ONT)
Plataforma
IONTorrent S5
Thermo Fisher Scientific
Plataforma
ABI 3500 XL
Applied Biosystem
SERVICIOS
Nuestro objetivo como proveedor de servicios de secuenciación es adaptar las plataformas y los métodos de preparación de muestras acorde a los objetivos y presupuesto de cada proyecto.
Electroforesis capilar
- Secuenciación de productos de PCR con purificación/ sin purificación.
- Secuenciación de marcadores fluoromarcados (Microsatélites, RFLP, AFLP, MLPA, SNPs, Indels).
- Secuenciación con bisulfito (análisis metilación).
Secuenciación Nueva Generación (NGS)
- Metabarcoding: comunidades bacterianas 16S (gen completo), comunidades fúngicas (regiones LSU, ITS, SSU), eucariotas (CO1)
- Genoma completo
- RNA-Seq
- Metagenómica
- Metiloma con Oxford Nanopore Technologies
PCR digital (dPCR)
- Expresión diferencial de genes
- Identificación de genes asociados a resistencia antimicrobiana en muestras ambientales.
- Detección de mutaciones
- Cuantificación absoluta de genes
Otros servicios
- Extracción de ácidos nucleicos
- Cuantificación de ADN/ARN y proteínas
- Electroforesis en gel de agarosa
- PCR en tiempo real
- Análisis filogéneticos
- Amplificación (PCR) marcadores moleculares para identificación de bacterias y hongos.
- Asesoría científica integral para el diseño experimental de proyectos de investigación que involucren el área de biología molecular.
EQUIPO
MSc. Esteban Chacón
Líder GenCore
Biólogo y magíster en Bioquímica.\ me.chacon@uniandes.edu.co
CONTACTO
gencore@uniandes.edu.co *Conmutador (601) 3394949 \ Extensión 3339*
Universidad de los Andes\ Carrera 1 N° 18a-10, Sótano Y\ Bogotá, Colombia
María Fernanda Ortiz
Técnico de laboratorio
Bacterióloga y laboratorista clínico, estudiante de la maestría de Biología Computacional.
Felipe Baez
Profesional de investigación
Microbiólogo de la Universidad de los Andes.
Maria Camila Sierra
Profesional de secuenciación
Microbióloga, estudiante de la maestría en Biología Computacional.\ Ver perfil ORCID
Applied Genomics Research Group (COL0212848)
El grupo Applied Genomics Research Group hace parte del Centro de Secuenciación – GenCore de la Vicerrectoría de Investigación y Creación de la Universidad de los Andes (Bogotá, Colombia), nuestro grupo fue creado en 2020 y ha participado en la formulación y ejecución de proyectos de Investigación enfocados en la implementación de técnicas de secuenciación y biología molecular.